نسب سید محمد خاتمی، رئیس‌جمهور اسبق کشورمان با حدود ۴۰ واسطه به حضرت علی (ع) و امام حسن (ع) می‌رسد.
شجره‌نامه به شرح زیر است:
سیدمحمد خاتمی پسر سید روح‌الله، پسر محمدرضا، پسر اسماعیل، پسر محمد، پسر جعفر، پسر میرابوطالب، پسر میرعلی‌اکبر، پسر میرجعفر، پسر رضی‌الدین، پسر محمد، پسر میر زین‌الدین، پسر نظام‌الدین، پسر رضی‌الدین، پسر علی، پسر شمس‌الدین، پسر محمد، پسر عزالدین، پسر یوسف، پسر مرتضی، پسر ثابت، پسر محمد، پسر علاءالدین، پسر مرتضی، پسر صدر، پسر حسن، پسر شهاب‌الدین، پسر علی، پسر ابومحمد، پسر حمزه، پسر طاهر، پسر علی، پسر محمد، پسر احمد، پسر محمد، پسر احمد، پسر رئیس، پسر ابراهیم، پسر طباطبا، پسر اسماعیل، پسر ابراهیم، پسر حسن حسینی، پسر حسن مثنی، پسر حسن (امام دوم شیعیان)، پسر علی (امام اول شیعیان)، پسر ابی طالب (عموی پیامبر اسلام).
منبع: صفحه آیت‌الله روح‌الله خاتمی در فیسبوک
